Istotnie istnieje szereg doniesień dotyczących zaburzeń elektrolitowych, jednak doniesienia te nie dotyczą hydrokolonoterapii, podczas której stosuje się tylko czystą wodę. Nie istnieją doniesienia dotyczące zaburzeń elektrolitowych u dorosłych, istnieje jednak możliwość nieznacznego zmniejszenia ilości elektrolitów u dzieci oraz u osób w podeszłym wieku.
Zaburzenia elektrolitowe, o których słyszy się czasami, są związane na przykład z wykonywaniem lewatyw z kawy, z naparu z rumianku, czy też wlewów z działającym hipertonicznie fosforanem sodu stosowanych w przygotowaniu do sigmoidoskopii.
Collonic Irrigations: A Review of the Historical Controversy and the Potential for Adverse Effects, Douglas G. Richards, Ph.D., David L. McMillin, M.A.,Eric A. Mein, M.D., and Carl D. Nelson Volume 12, ? 4, 2006, pp. 389-393